MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp25

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001850	AT	4	8	6907	6914	50 %	50 %	0 %	0 %	11496612
2	NC_001850	AT	3	6	6920	6925	50 %	50 %	0 %	0 %	11496612
3	NC_001850	TA	4	8	6929	6936	50 %	50 %	0 %	0 %	11496612
4	NC_001850	ATT	2	6	6939	6944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496612
5	NC_001850	T	6	6	6954	6959	0 %	100 %	0 %	0 %	11496612
6	NC_001850	CCA	2	6	6964	6969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11496612
7	NC_001850	ATA	2	6	7046	7051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496612
8	NC_001850	AG	3	6	7065	7070	50 %	0 %	50 %	0 %	11496612
9	NC_001850	AAT	2	6	7075	7080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496612
10	NC_001850	AAG	2	6	7121	7126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496612
11	NC_001850	ATA	2	6	7205	7210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496612
12	NC_001850	AG	3	6	7228	7233	50 %	0 %	50 %	0 %	11496612
13	NC_001850	T	6	6	7250	7255	0 %	100 %	0 %	0 %	11496612
14	NC_001850	AAG	2	6	7343	7348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496612
15	NC_001850	ATA	2	6	7363	7368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496612
16	NC_001850	A	8	8	7394	7401	100 %	0 %	0 %	0 %	11496612
17	NC_001850	ATT	2	6	7559	7564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496612
18	NC_001850	AAAC	2	8	7627	7634	75 %	0 %	0 %	25 %	11496612
19	NC_001850	ATG	2	6	7682	7687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496612
20	NC_001850	TGA	2	6	7749	7754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496612
21	NC_001850	ATG	2	6	7755	7760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496612
22	NC_001850	TTAAA	2	10	9559	9568	60 %	40 %	0 %	0 %	11496635
23	NC_001850	A	6	6	9583	9588	100 %	0 %	0 %	0 %	11496635
24	NC_001850	T	6	6	9654	9659	0 %	100 %	0 %	0 %	11496635
25	NC_001850	A	6	6	9669	9674	100 %	0 %	0 %	0 %	11496635
26	NC_001850	AC	3	6	9691	9696	50 %	0 %	0 %	50 %	11496635
27	NC_001850	T	6	6	9703	9708	0 %	100 %	0 %	0 %	11496635
28	NC_001850	A	6	6	9732	9737	100 %	0 %	0 %	0 %	11496635
29	NC_001850	TGC	2	6	9781	9786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496635
30	NC_001850	ATT	2	6	9804	9809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496635
31	NC_001850	ATC	2	6	9955	9960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496635
32	NC_001850	TCA	2	6	10051	10056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496635
33	NC_001850	ATC	2	6	10068	10073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496635
34	NC_001850	CAA	2	6	10082	10087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496635
35	NC_001850	TAT	2	6	10091	10096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496635
36	NC_001850	A	7	7	10124	10130	100 %	0 %	0 %	0 %	11496635
37	NC_001850	A	7	7	10138	10144	100 %	0 %	0 %	0 %	11496635
38	NC_001850	A	6	6	10164	10169	100 %	0 %	0 %	0 %	11496635
39	NC_001850	TAA	2	6	10185	10190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496635
40	NC_001850	T	9	9	10269	10277	0 %	100 %	0 %	0 %	364556622
41	NC_001850	ATT	2	6	10281	10286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556622
42	NC_001850	TCA	2	6	10291	10296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556622
43	NC_001850	TCT	2	6	10327	10332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556622
44	NC_001850	TTATT	2	10	10343	10352	20 %	80 %	0 %	0 %	364556622
45	NC_001850	T	6	6	10355	10360	0 %	100 %	0 %	0 %	364556622
46	NC_001850	AAT	2	6	10394	10399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556622
47	NC_001850	ATTG	2	8	10428	10435	25 %	50 %	25 %	0 %	364556622
48	NC_001850	GAT	2	6	10436	10441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556622
49	NC_001850	TTAT	2	8	10492	10499	25 %	75 %	0 %	0 %	364556622
50	NC_001850	CGT	2	6	10532	10537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	364556622
51	NC_001850	TTTAA	2	10	10573	10582	40 %	60 %	0 %	0 %	364556622
52	NC_001850	AAC	2	6	10623	10628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	364556622
53	NC_001850	TTC	2	6	10629	10634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556622
54	NC_001850	CTG	2	6	10660	10665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	364556622
55	NC_001850	TAA	2	6	10671	10676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556622
56	NC_001850	A	6	6	10675	10680	100 %	0 %	0 %	0 %	364556622
57	NC_001850	ATT	2	6	10693	10698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556622
58	NC_001850	T	6	6	11504	11509	0 %	100 %	0 %	0 %	11496613
59	NC_001850	TTC	2	6	11546	11551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496613
60	NC_001850	A	6	6	11577	11582	100 %	0 %	0 %	0 %	11496613
61	NC_001850	AT	3	6	11609	11614	50 %	50 %	0 %	0 %	11496613
62	NC_001850	TCT	2	6	11622	11627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496613
63	NC_001850	T	6	6	11672	11677	0 %	100 %	0 %	0 %	11496613
64	NC_001850	C	6	6	11684	11689	0 %	0 %	0 %	100 %	11496613
65	NC_001850	A	8	8	11703	11710	100 %	0 %	0 %	0 %	11496613
66	NC_001850	CTT	2	6	11761	11766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496613
67	NC_001850	TCTTTA	2	12	11871	11882	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	11496613
68	NC_001850	ATT	2	6	11940	11945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496613
69	NC_001850	CTTT	2	8	11949	11956	0 %	75 %	0 %	25 %	11496613
70	NC_001850	TCA	2	6	11985	11990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496613
71	NC_001850	AATT	2	8	11992	11999	50 %	50 %	0 %	0 %	11496613
72	NC_001850	TTTTAT	2	12	12038	12049	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	11496613
73	NC_001850	TCATT	2	10	12073	12082	20 %	60 %	0 %	20 %	11496613
74	NC_001850	T	7	7	12108	12114	0 %	100 %	0 %	0 %	11496614
75	NC_001850	A	6	6	12123	12128	100 %	0 %	0 %	0 %	11496614
76	NC_001850	TA	3	6	12156	12161	50 %	50 %	0 %	0 %	11496614
77	NC_001850	TTTA	2	8	12165	12172	25 %	75 %	0 %	0 %	11496614
78	NC_001850	A	6	6	12235	12240	100 %	0 %	0 %	0 %	11496614
79	NC_001850	ATC	2	6	12243	12248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496614
80	NC_001850	TTA	2	6	12254	12259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496614
81	NC_001850	GTT	2	6	12282	12287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496614
82	NC_001850	TAA	2	6	12354	12359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496614
83	NC_001850	ATT	2	6	12400	12405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496614
84	NC_001850	TTAC	2	8	12412	12419	25 %	50 %	0 %	25 %	11496614
85	NC_001850	AAT	2	6	12438	12443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496614
86	NC_001850	TAT	3	9	12465	12473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496614
87	NC_001850	TAA	2	6	12492	12497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496614
88	NC_001850	A	6	6	12548	12553	100 %	0 %	0 %	0 %	11496614
89	NC_001850	AT	4	8	12561	12568	50 %	50 %	0 %	0 %	11496614
90	NC_001850	ATT	2	6	12588	12593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496614
91	NC_001850	GAA	2	6	12610	12615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496614
92	NC_001850	T	8	8	12622	12629	0 %	100 %	0 %	0 %	11496614
93	NC_001850	TGTTT	2	10	12650	12659	0 %	80 %	20 %	0 %	11496614
94	NC_001850	TTC	2	6	12678	12683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496614
95	NC_001850	AGA	2	6	12736	12741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496614
96	NC_001850	T	6	6	12750	12755	0 %	100 %	0 %	0 %	11496614
97	NC_001850	A	6	6	12770	12775	100 %	0 %	0 %	0 %	11496614
98	NC_001850	CCT	2	6	12802	12807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11496614
99	NC_001850	ATTT	2	8	12850	12857	25 %	75 %	0 %	0 %	11496614
100	NC_001850	TCC	2	6	12863	12868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11496608
101	NC_001850	T	8	8	12902	12909	0 %	100 %	0 %	0 %	11496608
102	NC_001850	T	6	6	12947	12952	0 %	100 %	0 %	0 %	11496608
103	NC_001850	T	6	6	12958	12963	0 %	100 %	0 %	0 %	11496608
104	NC_001850	T	6	6	12965	12970	0 %	100 %	0 %	0 %	11496608
105	NC_001850	CTT	2	6	12987	12992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496608
106	NC_001850	AC	3	6	13003	13008	50 %	0 %	0 %	50 %	11496608
107	NC_001850	T	6	6	13013	13018	0 %	100 %	0 %	0 %	11496608
108	NC_001850	TA	3	6	13031	13036	50 %	50 %	0 %	0 %	11496608
109	NC_001850	T	6	6	13098	13103	0 %	100 %	0 %	0 %	11496608
110	NC_001850	AAT	2	6	13194	13199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496608
111	NC_001850	T	8	8	13224	13231	0 %	100 %	0 %	0 %	11496608
112	NC_001850	AT	3	6	13280	13285	50 %	50 %	0 %	0 %	11496608
113	NC_001850	T	6	6	13307	13312	0 %	100 %	0 %	0 %	11496608
114	NC_001850	T	8	8	13336	13343	0 %	100 %	0 %	0 %	11496608
115	NC_001850	ATT	2	6	13344	13349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496608
116	NC_001850	T	9	9	13352	13360	0 %	100 %	0 %	0 %	11496608
117	NC_001850	TTTCA	2	10	13385	13394	20 %	60 %	0 %	20 %	11496608
118	NC_001850	TA	3	6	13406	13411	50 %	50 %	0 %	0 %	11496609
119	NC_001850	ATT	2	6	13469	13474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496609
120	NC_001850	T	7	7	13480	13486	0 %	100 %	0 %	0 %	11496609
121	NC_001850	TGTT	2	8	13503	13510	0 %	75 %	25 %	0 %	11496609
122	NC_001850	TGT	2	6	13541	13546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496609
123	NC_001850	TA	4	8	13582	13589	50 %	50 %	0 %	0 %	11496609
124	NC_001850	TTA	2	6	13629	13634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496609
125	NC_001850	T	6	6	13650	13655	0 %	100 %	0 %	0 %	11496609
126	NC_001850	TATT	2	8	13677	13684	25 %	75 %	0 %	0 %	11496609
127	NC_001850	GTTT	2	8	13705	13712	0 %	75 %	25 %	0 %	11496609
128	NC_001850	T	8	8	13752	13759	0 %	100 %	0 %	0 %	11496609
129	NC_001850	CTT	2	6	13768	13773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496609
130	NC_001850	TTA	2	6	13774	13779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496609
131	NC_001850	T	6	6	13783	13788	0 %	100 %	0 %	0 %	11496609
132	NC_001850	T	7	7	13819	13825	0 %	100 %	0 %	0 %	11496609
133	NC_001850	T	6	6	13837	13842	0 %	100 %	0 %	0 %	11496609
134	NC_001850	T	6	6	13862	13867	0 %	100 %	0 %	0 %	11496609
135	NC_001850	ATA	2	6	13871	13876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496609
136	NC_001850	TTG	2	6	13909	13914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496609
137	NC_001850	T	7	7	13919	13925	0 %	100 %	0 %	0 %	11496609
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139	NC_001850	T	7	7	13973	13979	0 %	100 %	0 %	0 %	11496609
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.